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Résumé : La diversité génétique permet aux populations animales d’évoluer et de s’adapter. Les populations domestiques peuvent souffrir d’une diminution de cette diversité au cours du temps du fait d’un effectif limité et/ou d’une sélection importante. Les ressources biologiques conservées en cryobanque pourraient permettre de réintroduire, au sein des populations actuelles, cette diversité perdue au cours du temps. Cependant, par manque de recommandations, cela n’est quasiment jamais pratiqué. Cette thèse, en utilisant des données réelles et des simulations, a identifié les paramètres déterminant l’efficacité de telles pratiques à long terme et a permis de fournir des recommandations aux utilisateurs et aux gestionnaires, pour l’utilisation et la constitution des collections cryoconservées de ressources biologiques. Ces conclusions pourraient aussi être appliquées aux populations sauvages dans le cadre des réserves ou des parcs zoologiques.

Abstract : Genetic diversity enables animal populations to evolve and adapt. Domesticated populations can suffer from a reduction in this diversity over time, due to limited population size and/or strong selection. Biological resources preserved in gene banks could help to reintroduce this lost diversity into current populations. However, due to a lack of recommendations, this is almost never done. This thesis, using real data and simulations, has identified the parameters determining the effectiveness of such practices in the long term, and has provided recommendations to end users and managers, for the use and constitution of cryopreserved collections of biological resources. These conclusions could also be applied to wild populations in reserves or zoos.

Jury :

Nadir ALVAREZ, Rapporteur (Professeur, Université de Genève / Museum)
Sylvie MURATORIO, Rapporteur (Directrice de recherche, INRAE)
Christine DILLMANN, Examinateur (Professeur, Université Paris-Saclay)
Sonia EYNARD, Examinateur (Chercheur, INRAE)
Jérôme RAOUL, Examinateur (Ingénieur PhD., IDELE)
Michèle TIXIER-BOICHARD, Directrice (Directrice de recherche, INRAE)
Gwendal RESTOUX, Encadrant (Chargé de recherche, INRAE)